Трећа комора је једна од четири коморе у мозгу које међусобно комуницирају. Као и код осталих комора мозга, испуњен је цереброспиналном течношћу, која помаже у заштити мозга од повреда и транспорту хранљивих састојака и отпада. Трећа комора је уска шупљина која се налази између две половине мозга.
Трећа комора шаље поруке и прима поруке из бочних комора, које се налазе испред треће коморе, и аквадукта средњег мозга, који се налази непосредно иза треће коморе. Хипоталамус и таламус налазе се на боковима треће коморе.
Абнормалности треће коморе повезане су са различитим стањима, укључујући хидроцефалус, менингитис и вентрикуларитис. Хидроцефалус је прекомерно накупљање течности на мозгу. Менингитис је запаљење мембрана које покривају мозак и кичмену мождину, док је вентрицулитис запаљенско стање комора. Менингитис и вентрицулитис могу бити узроковани траумом коморе, укључујући и трећу комору, иако је трауматични менингитис реткост.
Повећана трећа комора повезана је са психијатријским болестима као што је шизофренија; међутим, тачност ове теорије није коначно доказана.